С отдельными окнами можно манипулировать так, как это принято у остальных аппликаций MS Windows. Окна можно передвигать по экрану, увеличивать или уменьшать, минимизировать на икону или увеличить на всю площадь главного окна программы. Эти же операции можно выполнять с главным окном. Подробные информации о манипуляции с окнами можно получить в Руководстве по MS Windows.
Программа сохраняет информации об открытых окнах в инициализационном файле, поэтому они, после окончания работы с программой и ее повторном запуске, снова автоматически открываются.
Для манипуляции с окнами служат команды в меню Окно.